Clontech 634352 SMART-Seq® Mouse BCR (with UMIs) 24 Rxns酶试剂盒

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小鼠BCR分析SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs)
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Clontech 634352 SMART-Seq® Mouse BCR (with UMIs) 24 Rxns ￥19,351 Clontech 634352 SMART-Seq® Mouse BCR (with UMIs) 24 Rxns Clontech 634352 SMART-Seq® Mouse BCR (with UMIs) 24 Rxns Clontech 634352 SMART-Seq® Mouse BCR (with UMIs) 24 Rxns
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Clontech 634352 SMART-Seq® Mouse BCR (with UMIs) 24 Rxns酶试剂盒 – 修饰性PEG

SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs)
· 完整的BCR分析：支持分析重链(IgG, IgM, IgA, IgD, IgE) 和轻链 (IgK, IgL)
· 灵活的样本起始条件：支持10 ng – 1 μg 小鼠脾脏、骨髓、淋巴结、全血以及PBMC来源的高质量RNA起始（RIN>7）
· 简化的操作流程：组分中的重、轻免疫球蛋白链引物以及酶均是预混形式
· 更可靠测序数据：SMARTer Oligo上引入UMI，用于校正测序错误和PCR偏差
· 灵活的测序平台选择：可自由选择V(D)J全长分析，或只分析CDR3
完整的实验与分析流程—搭配特别开发的Cogent NGS Immune Profiler Software 和Cogent NGS Immune Viewer，用于数据分析和可视化
注：本试剂盒不含index，可搭配使用Unique Dual Index (UDI) kits（单独销售）
 
■ 产品说明
SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs)是一款小鼠BCR NGS文库构建试剂盒。该试剂盒整合SMART（Switching Mechanism at 5′ end of RNA Template）全长cDNA合成技术与5’RACE技术，可捕获重链(IgA/D/E/G/M) 和轻链 (IgK/L)基因完整的V(D)J可变区，用于后续NGS分析。
该试剂盒支持不同起始量的RNA（RIN>7）起始，均可获得高品质的测序文库。比如小鼠脾脏、骨髓或者外周血单核细胞（PBMC）纯化的10 ng-1 μg的总RNA，也支持从小鼠血液或者淋巴结中提取的RNA样本。
该试剂盒中的重、轻免疫球蛋白链引物以及酶均是预混形式，减少了试剂组分数量和操作步骤。另外该试剂盒还包括特别的分子条形码（UMI），可以消除PCR错误或duplication以及测序偏向，从而确保获得更准确和可靠的结果。此外，搭配使用的双端特殊index（UDI，Unique Dual Index），可以提供完整的从样品到文库构建的实验体验。
该试剂盒所建文库支持更多样的测序平台。既支持Miseq平台（分析V(D)J全长信息），也支持其它Illumina平台（分析CDR3区），节约成本。
测序结束后，可以使用Cogent NGS Immune Profiler Software (Cogent IP)，直接对Illumina测序仪的下机数据进行高品质的BCR profiling分析，包括克隆型的鉴定与计数、V(D)J区域的序列分析。该软件支持高质量的BCR分析，包括克隆型计数和鉴别，以及V(D)J区域的序列信息。而且，使用基于云端的Cogent NGS Immune Viewer可以实现快速轻松地对Cogent IP的输出数据进行可视化展示。
 
■ 应用
· 用于分析组织和循环系统中的B细胞的克隆组织和多样性，了解它们如何影响B细胞的分化途径和功能。
· 发现具有高亲和力的BCR，以便更好地为疫苗接种或传染病治疗提供指导。
· 追踪抗原特异性B细胞在HIV以及其他疾病的小鼠模型中过继转移后的变化和迁移。
· 检查BCR序列，以研究针对新表位的自体抗体随时间的变化，以及这些变化如何与严重的自身免疫疾病相关联，如狼疮。
 
■ 建库原理
Clontech 634352 SMART-Seq® Mouse BCR (with UMIs) 24 Rxns
 
■ 不同起始量的克隆型检测数据
Clontech 634352 SMART-Seq® Mouse BCR (with UMIs) 24 Rxns
为了评价SMART-Seq Mouse BCR (with UMIs)的性能，以10 ng，100 ng和1,000 ng小鼠脾脏来源RNA起始制备文库，生成150万个测序reads。
Panel A. 检测所有重链(IgA/D/G/M，除了IgE，因为它在正常小鼠样本中的表达量非常低)和轻链 (IgK/L)。结果显示，随着起始量的增加，检测到的克隆型数量也随之增加。
Panel B. 结果显示，重链和轻链的克隆型数量随着起始量的增加也随之增加。
 
 
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